Музей создан в 1986 году.
В 2005 году прошел аттестацию. Решение аттестационной комиссии от 24.04.2005г. Протокол №04/05: «Аттестовать музей «Истории колледжа и Российского флота» Морского технического колледжа, как базу для проведения экскурсий и различных форм массово – патриотических мероприятий».
При музее работает объединение «Патриот».
В 2011 году музей стал победителем городского конкурса экскурсоводов.
С 2012 года по сентябрь 2016 музей находился на капитальном ремонте. Первая экскурсия после реконструкции проведена 22 октября 2016 года для учащихся 347 школы Невского района.