Учебный процесс отделения заочного и очно-заочного обучения характеризуется его гибкой организацией, позволяющей совмещать обучение с работой. Содержание заочной формы обучения соответствует по основным параметрам содержанию обучения по очной форме. Учащиеся обеспечены учебными пособиями, методическими рекомендациями, в которых учитывается специфика и особенности заочного обучения.
На обучение принимаются лица, имеющие среднее образование, годные по состоянию здоровья для работы на морском (речном) флоте. Лица, имеющие среднее и высшее профессиональное образование, зачисляются на сокращённый срок обучения по индивидуальным учебным планам. Обучение платное.