Курсантское самоуправление СПбМТА им. адмирала Д.Н.Сенявина это совокупность органов актива обучающихся, общественных и иных молодежных объединений и организаций, функционирующих в академии.

Целью Самоуправления является обеспечение реализации прав обучающихся на участие в управлении образовательным процессом.

Основной единицей для создания органов самоуправления академии, делегирования представителей, выборов делегатов на конференцию обучающихся Академии является учебная группа, которая на своём собрании избирает старшину группы, командиров отделений, физоргов и культоргов.

На конференции обучающихся академии создается объединенный совет обучающихся из представителей старшинского совета, совета физоргов, социально-культурного курсантского совета, иных молодежных организаций, действующих в СПбМТА им. адмирала Д.Н.Сенявина (центр волантёрства и добровольчества, парадный расчёт, Молодёжный Морской Совет Санкт-Петербурга и др.), а также из иных представителей обучающихся академии.

Конференция обучающихся является высшим органом Самоуправления. На ней формируется Объединённый совет обучающихся, который является коллегиальным органом управления академии и формируется по инициативе обучающихся с целью учёта мнения обучающихся по вопросам управления академиией и при принятии локальных нормативных актов, затрагивающих права и законные интересы обучающихся. Деятельностью объединённого совет обучающихся руководит избираемый ежегодно председатель этого совета.

Курсантский актив начинает формироваться при анализе личных дел ещё на этапе зачисления абитуриентов. Затем уже в группах при содействии мастеров производственного обучения и классных руководителей формируется курсантский актив. Формальным актом его утверждения становится проведение ежегодной конференции обучающихся.

В период учёбы каждый желающий может себя проявить. В повседневной жизни во время построений, занятий, вахт очень важна роль старшины, а командиры отделений становятся его незаменимыми помощниками. Физорги работают в тесном взаимодействии с преподавателями физического воспитания. Наиболее широкие возможности для проявления творчества даёт социально-культурный курсантский совет, ведь без помощи ребят не проходит практически ни одно мероприятие академии.

То же самое касается и парадного расчёта. Ребята обеспечивают торжественные встречи не только в родных стенах, их часто приглашают на мероприятия районного и городского уровня.

Особая роль у Молодёжного Морского Совета Санкт-Петербурга. Это городская организация, в которую входят представители образовательных организаций, клубов, предприятий морского профиля. Участники регулярно проводят заседания, встречи, ярмарки морских профессий, участвуют в организации и проведении городских мероприятий.

Также представители академии ведут активную работу в рядах Совета учащейся молодёжи Санкт-Петербурга, действующего на базе Дворца учащейся молодёжи Санкт-Петербурга.

За многие годы у волонтёрской и добровольческой команды академии с названием «Пилигрим» уже сложились традиции в работе с детскими домами, помощи детским медицинским учреждениям и учреждениям культуры при проведении благотворительных мероприятий, участии в слётах, экологических и волонтёрских выездах, в уходе за памятниками, участии в Дне донора.

Не оставляют вниманием активисты и студенческие конференции и форумы, где можно почерпнуть для себя что-то новое и обменяться опытом.

Актив курсантов академии неоднократно был удостоен различных наград, а сама система самоуправления на городском конкурсе по профилактике асоциальных явлений в молодёжной среде в 2016 году была отмечена специальным призом.

Положение о курсантском самоуправлении СПбМТА им. адмирала Д.Н.Сенявина.